欺诈发行股票、债券罪与集资诈骗罪都实施了欺骗他人的行为，但二者的区别是明显的，表现在：
（1）犯罪主体不同。
本罪主体为特殊主体：即股份有限公司的发起人，股份有限公司、有限责任公司和企业；而集资诈骗罪的主体则为一般主体，主要是社会上一些不法分子打着公司的旗号，虚构公司、企业或假冒公司、企业实施的。
（2）主观方面不同。
两罪虽然在主观上均为故意，但其内容和目的有所不同。本罪有虚假发行股票或公司、企业债券的故意和非法募集资金的目的，而非法募集资金是由于筹建公司、企业或公司、企业本身的业务发展，不具有非法占有的目的；而集资诈骗罪则有非法占有他人财产的目的。即行为人具有将非法聚集的资金据为己有的目的。
（3）侵犯的客体不同。
本罪侵犯的是股东、债券人及社会公众的利益和国家的证券市场管理制度；而集资诈骗罪侵犯的是公私财产所有券和国家金融管理制度。
（4）客观方面不同。
本罪是违反公司法的规定，是在公司发行股票或公司、企业发行债券的领域内犯罪，即以虚假方法制作虚假的招股说明书、认股书、公司、企业债券发行办法来欺诈他人，发行股票、债券一般是通过有关部门审批后进行的；而集资诈骗罪可以采取多种方法，其行为人发行股票、债券是未经有关部门批准而非法发行的。
